Guerra Civil

En Stamford, en el Estado de Connectiut, se produjo la pelea televisada entre los Nuevos Guerreros y un grupo de villanos escapados hacía poco de la Balsa. Los jóvenes héroes entraron en combate sin tener en cuenta que estaban en una zona poblada rodeada de inocentes, como consecuencia de la batalla, uno de los villanos, Nitro, provocó una enorme explosión que provocó la muerte de 612 civiles, entre ellos 60 niños de una escuela cercana. Esta tragedia despertó un sentimiento en contra de los super humanos por parte de la población y allanó el camino hacia la aprobación del Acta de Registro Super Humano, en vísperas de la aprobación en el Congreso.

Solo horas antes de la presentación del Acta para su votación, los héroes más representativos entre los que se encontraban los Vengadores, los Jóvenes Vengadores, los 4 Fantásticos, Daredevil, el Doctor Extraño o la Patrulla-X se reunieron para intentar presentar un frente común, de nuevo Iron Man y Reed Richards intentaron convencer a sus iguales de la necesidad de firmar el Acta, pero gente como Luke Cage, Lobezno o Daredevil se negaban.

A esta reunión no acudió el Capitán América que fue convocado al Helitransporte por la nueva directora de SHIELD, Maria Hill, que pretendía que encabezara una unidad para dar caza a aquellos que se negaran a firmar el Acta. Sin embargo el Capitán América no solo se negó a encabezar esta unidad, sino que estaba en contra de la propia Acta, esto provocó que Hill diera la orden de capturar al Capi que huyó del Helitransporte convirtiéndose en un fugitivo.

En torno al Capitán América se aglutinaron todos aquellos superhombres que estaban en contra del Acta, gente como Luke Cage, Daredevil, el Halcón, los Jóvenes Vengadores, Hércules... todos dispuestos a enfrentarse a una ley en la que no creían. En el otro bando, tres de las mentes mas brillantes del planeta encabezan el grupo pro Registro, se trataban de Iron Man, Mister Fantástico y Hank Pym. Este trío se reunió tras la desastre de Stamford y decididos a que algo así no volviera a ocurrir, idearon 100 nuevas ideas para impedir el actual clima de descontrol super humano. Entre estas ideas se encontraban algunas como la creación de una prisión para super humanos en la Zona Negativa que impediría que en caso de fuga el fugado tuviera fácil acceso, la creación de un campo de entrenamiento para super humanos y otras.... Entre las ideas de estos tres genios se encontraba lo que consideraban un mal menor para lograr el objetivo de una comunidad super humana bien entrenada, el registro super heróico y lo que llamaron la Iniciativa de los 50 Estados, destinada a crear en cada Estado a un grupo de héroes entrenados y adiestrados.

Con los recursos financieros de Stark a su disposición, con los recursos logísticos de SHIELD y con la aprobación del gobierno federal, el Acta pasó a convertirse en ley. A partir del minuto siguiente que el Acta fue aprobada, todos aquellos super hombres que no estaban registradas fueron conminados a hacerlo, en caso de negarse, eran perseguidos por unidades especiales de SHIELD, los "mata-capas" equipados con alta tecnología y usando su número, eran capaces de reducir a casi cualquier héroe.

En caso que estos "mata-capas" no fueran suficientes, las fuerzas pro Registro contaban también con la ayuda de mercenarios, e incluso contaron con la ayuda de algunos super villanos, como era el caso del Bufón, Dama Mortal, Bullseye, el Supervisor o Jack O´Lantern que habían sido capturados por los Thunderbolts de Zemo, grupo formado por antiguos villanos reformados. Entre estos Thunderbolts se encontraba el Hombre Radiactivo que también ayudó a Richards y Pym en la creación de la prisión en la Zona Negativa, conocida como "42" (por el número que ocupaba en la lista de 100 ideas) o Isla Fantasía, como era conocida por los reclusos. La prisión fue creada para contener a los supervillanos y a los super héroes que se negaban a firmar el Acta, cuando una anomalía temporal trajo al presente al fallecido Capitán Marvel desde el pasado, Iron Man y Richards lo convencieron para que dirigiera la prisión.

Mientras tenía lugar el enfrentamiento entre las fuerzas pro Registro y las fuerzas anti Registro, los planes de Stark y compañía para la Iniciativa seguían su curso, y crearon dos campos de entrenamiento para héroes, uno en Quantico, Virginia y otro en la Torre Stark en Nueva York. También comenzaron un programa para crear nuevos super hombres tanto para ayudarles en la guerra que estaban librando, como para la post guerra y los planes de la Iniciativa, este programa creó héroes mediante ingeniería genética o dotándoles de tecnología, también crearon un clon utilizando células obtenidas del largo tiempo desaparecido Dios del Trueno, Thor, sin embargo estos clones demostraron ser muy inestables y durante una batalla asesinó a uno de los héroes anti registro, Bill Foster alias el Goliat Negro antes que Hércules lo destruyera.

Sin bien el asesinato de Foster atrajo a más héroes hacia el bando anti Registro como dos de los 4 Fantásticos, la Pantera Negra y Tormenta o Namor y sus atlantes, la Guerra Civil terminó cuando el Capitán América comprendió que la mayor parte del pueblo americano apoyaba el Acta de Registro, y decidió entregarse a las autoridades ordenando a sus seguidores que detuvieran la batalla.

El Capi sin embargo no fue llevado a la Zona Negativa, ya que mientras se encontraba bajo custodia, fue asesinado como parte de un complot urdido por dos de sus enemigos, Cráneo Rojo y el Doctor Faustus.

Tras la rendición del Capitán América, la mayoría de los héroes anti Registro decidieron aceptar la amnistía ofrecida por el gobierno a cambio que se registraran, otros sin embargo abandonaron el país como el caso de Spiderwoman, otros creyeron que podían seguir actuando como siempre lo habían hecho aunque pronto salieron de su error ya que fueron perseguidos por los Thunderbolts, como fue el caso de Americop o Jack Flag, otros abandonaron toda actividad super heróica como Estrella de Fuego o Wiccan, pero unos pocos, aglutinados en torno a Luke Cage, formaron un grupo clandestino de Vengadores que seguía oponiéndose al Acta.